Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms