Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CT47B1P0C2W7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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