Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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