Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms