Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms