Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms