Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms