Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms