Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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