Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms