Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms