Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms