Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC17Q9NP64 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms