Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms