Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA7Q9BWT1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDCA7Q9BWT1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms