Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms