Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms