Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms