Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms