Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF220Q5VTB9 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms