Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms