Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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HIST2H2BEQ16778 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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HIST2H2BEQ16778 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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HIST2H2BEQ16778 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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HIST2H2BEQ16778 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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HIST2H2BEQ16778 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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HIST2H2BEQ16778 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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HIST2H2BEQ16778 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIST2H2BEQ16778 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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