Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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