Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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