Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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