Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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