Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
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