Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
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SYCP1Q15431 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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SYCP1Q15431 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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