Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
R3HDM1Q15032 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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