Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IKBKEQ14164 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
IKBKEQ14164 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IKBKEQ14164 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IKBKEQ14164 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IKBKEQ14164 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IKBKEQ14164 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKBKEQ14164 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms