Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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ATP1A4Q13733 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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