Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms