Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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