Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms