Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MC1RQ01726 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms