Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHC1P78364 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHC1P78364 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHC1P78364 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHC1P78364 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHC1P78364 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHC1P78364 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHC1P78364 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHC1P78364 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHC1P78364 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PHC1P78364 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHC1P78364 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHC1P78364 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHC1P78364 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHC1P78364 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHC1P78364 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHC1P78364 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHC1P78364 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHC1P78364 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PHC1P78364 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHC1P78364 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHC1P78364 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHC1P78364 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHC1P78364 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHC1P78364 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHC1P78364 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHC1P78364 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms