Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms