Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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CTBP2P56545 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CTBP2P56545 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CTBP2P56545 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms