Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLK1P49759 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLK1P49759 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLK1P49759 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLK1P49759 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLK1P49759 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLK1P49759 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLK1P49759 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLK1P49759 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLK1P49759 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLK1P49759 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLK1P49759 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLK1P49759 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLK1P49759 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLK1P49759 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLK1P49759 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLK1P49759 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLK1P49759 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLK1P49759 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLK1P49759 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLK1P49759 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLK1P49759 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLK1P49759 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLK1P49759 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLK1P49759 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLK1P49759 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms