Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK1EP49674 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms