Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XCR1P46094 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XCR1P46094 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XCR1P46094 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XCR1P46094 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XCR1P46094 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
XCR1P46094 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XCR1P46094 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XCR1P46094 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XCR1P46094 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XCR1P46094 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XCR1P46094 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XCR1P46094 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XCR1P46094 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XCR1P46094 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCR1P46094 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCR1P46094 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCR1P46094 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCR1P46094 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCR1P46094 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCR1P46094 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCR1P46094 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCR1P46094 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCR1P46094 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCR1P46094 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCR1P46094 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCR1P46094 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCR1P46094 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCR1P46094 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCR1P46094 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCR1P46094 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCR1P46094 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCR1P46094 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCR1P46094 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCR1P46094 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms