Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms