Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBP1P32455 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBP1P32455 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBP1P32455 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBP1P32455 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBP1P32455 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBP1P32455 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBP1P32455 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBP1P32455 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GBP1P32455 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBP1P32455 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBP1P32455 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBP1P32455 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms