Protein–RNA interactions for Protein: P22735

TGM1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM1P22735 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM1P22735 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM1P22735 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM1P22735 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM1P22735 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM1P22735 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM1P22735 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM1P22735 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM1P22735 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM1P22735 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM1P22735 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM1P22735 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM1P22735 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM1P22735 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM1P22735 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM1P22735 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGM1P22735 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM1P22735 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM1P22735 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM1P22735 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM1P22735 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms