Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms