Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAV1P15498 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAV1P15498 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VAV1P15498 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VAV1P15498 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAV1P15498 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAV1P15498 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAV1P15498 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VAV1P15498 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAV1P15498 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAV1P15498 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAV1P15498 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAV1P15498 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAV1P15498 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAV1P15498 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAV1P15498 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAV1P15498 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAV1P15498 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAV1P15498 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAV1P15498 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VAV1P15498 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAV1P15498 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAV1P15498 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VAV1P15498 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VAV1P15498 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAV1P15498 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAV1P15498 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAV1P15498 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAV1P15498 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAV1P15498 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAV1P15498 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms