Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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UBL4AP11441 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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