Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms