Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAB2O43741 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms