Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms